Жизнь словно история и в одном движении может быть увлекательная история.
Время открытия мемориального камня у реки Унгру, первого места крещения союза ЕХБ Эстонии, достигает эпохи национального пробуждения в конце 19 века, когда два шведских учителя Thóren и Österblom начали проповедовать в зданиях школ Ноароотси. По тому, как хорошо их приняли, можно было считать, что душа эстонского крестьянина тосковала по простой и личной вере. Всё больше появлялось хуторских домов, где люди собирались и изучали Библию, в результате чего возникли независимо свободные общины. До сего дня в общинах союза ЕХБ сохранилось чаяние строить свою веру и жизнь общины на основании Слова Божьего.
В 1884 году в Хаапсалу, Кярдла, Таллинне и Пярну были созданы первые баптистские общины. В течение нескольких десятилетий возникли общины по всей Эстонии, в них была активная работа воскресных школ и певческих хоров. Также была очень важна печатная деятельность. Баптистские церкви были известны хорошими проповедями. Через несколько лет (1886) общины стали работать совместно и  в 1900 баптистские церкви Эстонии образовали отдельный союз. На самом деле начало не было лёгким, но трудности создали предпосылки к дальнейшему росту.
1876 Начало пробуждения на Вормси.
1882  В Ридала появилась первая свободная община.
1884  В Хаапсалу, Кярдла, Таллинне и Пярну были созданы первые баптистские церкви.
1886  Общегосударственные конференции баптистов.
1890  Начало работы воскресных школ и певческих хоров.
1897  Некоторые свободные общины объединяются с баптистами.
1900  Баптистские церкви Эстонии образовали отдельный союз. Позже создаётся миссионерская работа  в Камеруне, Египте и Китае.
1904  Баптисты начинают выпускать журнал «Teekäija».
1905  Начало движения евангельских христиан.
1912  Баптисты начинают выпускать молодежный журнал «Elukevad».
1917  Начало молодежной  (позже и юношеской) работы баптистских общин.
5.3.1922 в Кейла открыли семинарию баптистских проповедников Эстонии.
1924  Создаются первые пятидесятнические церкви.
1936  Основан Союз свободных общин евангельских христиан.  Издаётся журнал ”Evangeeliumi Kristlane”. Миссионерская работа в Египте.
1937 Пятидесятнические церкви  объединяются с союзом Евангельских христиан.
1940 Закрыта Эстонская баптистская теологическая семинария.
1945 Союз ЕХБ Эстонии (начало в 1884, а в 1940 - 7500 членов), Союз свободных общин евангельских христиан Эстонии (начало в 1905, а в 1940 - 3000 членов), Эстонский союз евангельских  объединений евангелия Иисуса Христа (начало в 1882, а в 1940 - 2000 членов) объеденены властями в Эстонский союз  евангельских христиан и баптистов и присоединены к совету союза ЕХБ.
1956-1960 в Таллинне состоялись заочные теологические курсы.
1988  Открыто новое начало работы воскресной школы.
1989  Снова открыт Высший Теологический семинар в Таллинне.
9.12.1989  Основан преемник существующего по сей день Союза ЕХБ Эстонии. На тот момент в союзе было 80 общин и 5793 членов.
12.9.1994 в Тарту открыто новое здание Высшей Теологической семинарии.
17.1.2006 Канцелярия Союза переехала на ул. Коскла 18 в Таллинне.
На сегодняшний день в союзе ЕХБ 82 общины и 6327 членов. Воскресную школу посещает 860 детей (до 12 лет), 280 подростков, 452 человека из молодежи. Союз ЕХБ Эстонии вместе с детьми, подростками, молодежью и друзьями насчитывает 9000 человек (01.01.2014)